一般人們認為ISO9000與HACCP是不同的，實際上兩者有許多

共同之處：

• 均需要全體員工參與
• 均結構嚴謹,重點明確
• 均要持續性改進

目的均是使消費者 (用戶) 信任。

不同點在於：

• HACCP是食品安全控制系統
• ISO 9000適用於所有工商業及各類型組織
• 其中ISO 9001是企業質量保證體系
• 其中ISO 9004是企業品質管制體系

而 HACCP 是企業對某一產品安全性控制的要求，HACCP為"危害預防" ，而非針對最終產品檢驗，一般企業也採用相近的控制系統生產高品質產品。在這個世紀，HACCP 將成為食品生產廠家及銷售商安全管理的重要工具,並將向法律形式發展。1993年6月份,歐共體委員會發佈的食品衛生新法令中規定— "食品行業應明確保證食品安全的關鍵步驟，並保證按HACCP原則貫徹執行安全操作步驟"。

HACCP 是分析和測定關鍵控制點的一項專門技術，它必需根據產品的生產加工及設備等因素相應制定。HACCP 是一個動態的、詳細的體系，不是檔化就行了。這點也是與ISO相同的。